Действительный член РАН (2008, член-корреспондент РАН с 1991, член-корреспондент АН СССР с 1984).
Лауреат Государственной премии СССР (1980).
В Московском университете работает с 1979 г., сначала на кафедре АСВК в должностях: старшего преподавателя (1979-1985), доцента (1985-1986), профессора (с 1986). С 1994 по 2016 г. заведовал кафедрой системного программирования.
Заведующий кафедрой системного программирования МФТИ (с 1996 по 2016).
Главный редактор журнала «Программирование». Член международных научных сообществ ACM, IEEE Computer Society; возглавлял Российское отделение IEEE Computer Society.
Область научных интересов: системное программирование, архитектура вычислительных машин, операционные системы.
В.П. Иванников с 1962 по 1980 гг. работал в Институте точной механики и вычислительной техники им. С. А. Лебедева, где прошел путь от техника до одного из ведущих специалистов. Внес фундаментальный вклад в создание теории и в практику разработки операционных систем ЭВМ и вычислительных комплексов. Являлся одним из основных участников создания первой операционной системы (Д-68) для ЭВМ БЭСМ-6. В. П. Иванниковым были предложены операционные средства организации параллельных процессов в задачах и иерархической организации программных комплексов. Эти принципы, реализованные в следующей модификации операционной системы (НД-70) для БЭСМ-6, легли в основу его кандидатской диссертации.
В.П. Иванников один из основных разработчиков структуры процессоров и общей архитектуры многомашинного вычислительного комплекса АС-6, руководитель и активный участник создания и внедрения операционной системы неоднородной локальной сети ЭВМ на базе комплекса АС-6 (этой проблематике посвящена его докторская диссертация). Ему принадлежит существенная роль в создании вычислительных комплексов, обеспечивающих обработку информации в режиме реального времени в центрах управления полетами космических аппаратов.
В 1980-х гг. В.П. Иванников, работая в НИИ «Дельта» Минэлектронпрома СССР и в Институте проблем кибернетики АН СССР, руководил созданием и внедрением систем автоматизации проектирования и программного обеспечения суперЭВМ. С 1991 по 1994 гг. заведовал отделением Института проблем кибернетики РАН.
В.П. Иванников являлся директором Института системного программирования РАН со времени образования ИСП (январь 1994) по 2015 год. С 2015 по 2016 год он являлся научным руководителем ИСП. Его исследования конца 1990-х - начала 2000-х гг. связаны с созданием системы автоматизации разработки формальных спецификаций по исходным текстам программ и системы генерации тестов для широкого класса программных интерфейсов, инструментальной системы для изучения унаследованного программного обеспечения, а также с обеспечением интероперабельности в распределенных объектно-ориентированных системах. В. П. Иванников руководитель рабочей группы DOOS (распределенные объектно-ориентированные системы) в ИСП РАН.
Читал лекционные курсы: «Операционные системы», «Базы данных», «Алгоритмы и алгоритмические языки».
Подготовил 5 докторов и 30 кандидатов наук.
Опубликовал свыше 100 научных работ, зарегистрировал 2 изобретения. Основные научные труды:
Система математического обеспечения БЭСМ-6 (1967);
Вычислительная машина БЭСМ-10. Аппаратура. Эскизный проект (1973);
Архитектура операционной системы суперЭВМ (1984).